研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jun 30
ZhehaoFan,Shuangshua...
Unlocking epigenetics for precision treatment of Ewing's sarcoma.
Epigenetics & Chromatin
尤文氏肉瘤 (EWS) 是一种高度侵袭性的恶性骨肿瘤,主要影响青少年和年轻人。尽管放化疗在某些情况下有效,但转移性和复发性疾病患者的治愈率仍然很低。因此,迫切需要创新的治疗方法来解决与 EWS 治疗相关的挑战。表观遗传调控是生理过程中的关键因素,在控制细胞增殖、维持基因完整性和调节转录方面发挥着重要作用。最近的研究强调了异常表观遗传调控在 EWS 的发生和进展中的重要性。全面了解 EWS 与异常表观遗传调控之间复杂的相互作用对于推进临床药物开发至关重要。本综述旨在对 EWS 涉及的两个表观遗传靶点进行全面概述,整合各种治疗方式,为 EWS 的临床诊断和治疗提供创新视角。版权所有 ©2024 中国癌症研究杂志。版权所有。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug
HabibullaImran,Hyun-...
Ultrasensitive detection of 5-hydroxymethylcytosine in genomic DNA using a graphene-based sensor modified with biotin and gold nanoparticles.
Epigenetics & Chromatin
10-11 易位 (TET) 蛋白通过将 5-甲基胞嘧啶氧化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC) 来协调脱氧核糖核酸 (DNA) 甲基化-去甲基化动力学,并且在各种癌症中经常失活。由于 5hmC 作为表观遗传生物标志物对于癌症诊断、发病机制和治疗的重要性,因此对其快速、精确的定量至关重要。在这里,我们报告了一种高度灵敏的电化学方法,使用石墨烯片定量基因组 5hmC,该石墨烯片通过单步电学方法用生物素和金纳米颗粒 (Bt-AuNP) 进行电化学剥离和功能化。 Bt-AuNPs 与石墨烯的结合增强了含有 5hmC 的 DNA 的特异性,并增强了 DNA 中 5hmC 氧化为 5-甲酰胞嘧啶的能力。当与金电极耦合时,基于 Bt-AuNP-石墨烯的传感器在检测 5hmC 方面表现出卓越的灵敏度和特异性,检测限为 63.2 fM。此外,我们的传感器表现出卓越的能力,可以测量一系列生物样品的 5hmC 水平,包括由于 TET 基因破坏或致癌转化而具有不同 5hmC 水平的临床前小鼠组织,以及人类前列腺癌细胞系。因此,我们的传感策略在癌症诊断和预后方面具有巨大潜力。© 2024 作者。由爱思唯尔有限公司出版
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jun 30
ChenghaoLuo,QingfanM...
SYT7 promotes breast cancer cells growth through the PI3K/AKT pathway.
Epigenetics & Chromatin
乳腺癌是生殖系统最常见的恶性肿瘤之一,预后较差。本研究的目的是探讨突触结合蛋白7(SYT7)在乳腺癌中的功能和潜在机制。我们利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和Kaplan-Meier绘图仪数据库来评估SYT7表达与预后之间的相关性的乳腺癌患者。通过逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和蛋白质印迹评估SYT7敲低的功效。此外,我们使用细胞计数试剂盒-8 (CCK-8)、克隆形成测定和流式细胞术检查了 SYT7 对乳腺癌细胞增殖和凋亡的影响。通过Western blot分析,我们研究了SYT7对乳腺癌组织中凋亡相关标志物表达及PI3K/AKT信号通路的影响。TCGA数据库数据分析显示,与正常对照组相比,乳腺癌组织中SYT7表达显着上调。正常组织(P<0.001)。在乳腺癌患者中观察到SYT7表达与肿瘤大小(P=0.009)、雌激素受体(ER)表达水平(P<0.001)和孕激素受体(PR)表达水平(P<0.001)之间存在相关性。 Kaplan-Meier 绘图仪数据库的分析表明,高 SYT7 表达与较短的总生存期 (OS) 相关 (P=0.009)。 mRNA表达结果显示,乳腺癌组织中SYT7表达量高于癌旁正常组织(P=0.005)。 CCK-8、克隆形成实验和流式细胞术结果表明SYT7促进乳腺癌细胞增殖并抑制乳腺癌细胞凋亡。 Western blot检测证实了SYT7对PI3K/AKT信号的激活。研究结果表明SYT7在乳腺癌中高表达,并且其高表达与临床特征和预后相关。通过敲低抑制SYT7可以抑制乳腺癌细胞的增殖并促进其凋亡,使其成为乳腺癌诊断和治疗的潜在靶点。2024转化癌症研究。版权所有。
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Epigenetics & Chromatin
2024
FedericaGuffanti,Ila...
BRCA1 foci test as a predictive biomarker of olaparib response in ovarian cancer patient-derived xenograft models.
Epigenetics & Chromatin
高级别卵巢癌的标准治疗包括手术,然后进行铂类化疗和聚 ADP 核糖聚合酶抑制剂 (PARPis)。同源重组修复 (HRD) 缺陷是几乎一半的高级别卵巢癌的特征,这是由于参与 HR 修复的基因(主要是 BRCA1/BRCA2)的遗传和表观遗传改变所致,并预测对 PARPi 的反应。用于定义肿瘤 HRD 状态的学术和商业测试依赖于 DNA 测序分析,而 RAD51 病灶测定等功能测试目前正在研究中,但尚未得到验证且可供患者使用。在一个充分表征的卵巢癌患者来源的异种移植平台中,该平台对顺铂和奥拉帕尼(一种 PARPi)的反应是已知的,我们评估了 BRCA1 病灶评分之间的关​​联,该评分是通过免疫荧光技术在福尔马林固定石蜡包埋的肿瘤切片中确定的,和其他 HRD 生物标志物,并探索了 BRCA1 病灶测试预测肿瘤对顺铂和奥拉帕尼反应的潜力。 BRCA1 病灶评分与肿瘤的 HRD 状态和 RAD51 病灶评分相关。低 BRCA1 病灶评分可预测对奥拉帕尼和顺铂的反应,而高评分则与治疗耐药相关。正如我们最近发表的那样,在我们的异种库中,低 RAD51 病灶评分可预测奥拉帕尼的敏感性,我们将这两个评分结合起来,结果表明预测值优于单一测试。这项研究首次报告了 BRCA1 病灶测试识别 HRD 卵巢癌并可能预测对 olaparib 反应的能力。版权所有 © 2024 Guffanti、Mengoli、Alvisi、Dellavedova、Giavazzi、Fruscio、Rulli 和 Damia。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jul 19
GaIBan,VijithaPuviin...
The COMPASS complex maintains the metastatic capacity imparted by a subpopulation of cells in UPS.
Epigenetics & Chromatin
肿瘤内异质性在癌症中很常见,特别是在未分化多形性肉瘤(UPS)等肉瘤中,其中单个细胞表现出高度的细胞源多样性。先前的研究表明,UPS 内的一小部分细胞(称为转移克隆 (MC))负责转移。使用基于 CRISPR 的体内基因组筛选,我们确定了 COMPASS 复合体成员 Setd1a 是维持小鼠 UPS 中 MC 转移表型的关键调节因子。 Setd1a 的缺失抑制了 MC 的转移发展。转录组和染色质测序显示 UPS 中的 COMPASS 复杂靶基因(例如 Cxcl10)在 MC 中下调。删除非 MC 细胞中的 Cxcl10 会增加其转移潜力。用 COMPASS 复合物抑制剂治疗带有人类 UPS 异种移植物的小鼠,可以抑制转移,而不影响原发肿瘤的肿瘤生长。我们的数据确定了肉瘤细胞亚群中维持转移潜力的表观遗传程序。© 2024 作者。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jul 19
YongZang,AiyuanWang,...
Hypoxia promotes histone H3K9 lactylation to enhance LAMC2 transcription in esophageal squamous cell carcinoma.
Epigenetics & Chromatin
缺氧促进食管鳞状细胞癌(ESCC)的肿瘤发生和乳酸积累。乳酸可以诱导组蛋白赖氨酸乳酰化(Kla,最近发现的一种组蛋白标记)来调节转录。然而,组蛋白 Kla 在 ESCC 缺氧条件下的功能后果仍有待探索。在这里,我们发现缺氧促进组蛋白 H3K9la 增强 LAMC2 转录,从而促进 ESCC 的增殖。我们发现缺氧下 Kla 的整体水平升高,因此通过定量蛋白质组学鉴定了 ESCC 中组蛋白 Kla 的分布。此外,我们发现缺氧诱导 H3K9la 水平显着增加。接下来,MNase ChIP-seq 和 RNA-seq 分析表明 H3K9la 在细胞连接基因的启动子处富集。最后,我们通过体内和体外实验证明组蛋白 H3K9la 促进 LAMC2 的表达以促进 ESCC 侵袭。简而言之,我们的研究揭示了缺氧引发的组蛋白 Kla 在癌症中的重要作用。© 2024 作者。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024
IñakiEguren-Santamar...
Short-term cultured tumor fragments to study immunotherapy combinations based on CD137 (4-1BB) agonism.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
癌症免疫治疗的生物标志物是一个未得到满足的医疗需求。 NKI 的 Daniela Thommen 小组最近报道了一种基于患者来源肿瘤碎片短期培养的新方法,其上清液中的细胞因子浓度和浸润 T 细胞上的激活标记物与 PD-1 阻断的临床反应相关。我们利用肿瘤衍生片段建立了类似的培养技术,将小鼠肿瘤移植到同基因免疫活性小鼠体内,以测试激动剂抗 CD137 mAb 及其与抗 PD-1 和/或抗 TGF-β 的组合。使用抗 CD137 和抗 PD-1 mAb 组合或刀豆球蛋白 A 作为阳性对照进行培养物激活后,检测到组织培养上清液中 IFNγ 浓度的增加。广泛的阵列中没有其他细胞因子能够提供这些单克隆抗体刺激的信息。有趣的是,72 小时培养结束时收集的细胞悬浮液中的淋巴细胞证实了 Ki67 和其他激活标记物的增加。在患有双侧肿瘤的小鼠中,在体内抗 CD137  抗 PD-1 治疗之前切除一个肿瘤以进行片段培养评估,没有发现片段产生的 IFNγ 与非小鼠体内治疗结果之间存在关联。切除对侧肿瘤。该实验系统允许冷冻和解冻具有相似功能结果的碎片。使用一系列来自切除的实体恶性肿瘤的患者来源的肿瘤碎片,我们在一小部分研究病例中显示了 IFNγ 的产生,这些碎片保存在冷冻/解冻的碎片中。小肿瘤碎片培养技术似乎适合临床前探索免疫治疗组合。© 2024 作者。经泰勒许可出版
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024
YanhuiPeng,YurongHua...
Huangqin Qingre Chubi Capsule inhibits rheumatoid arthritis by regulating intestinal flora and improving intestinal barrier.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
临床前和确诊的类风湿性关节炎(RA)患者肠道菌群和肠道屏障的变化表明肠道菌群和肠道屏障在RA的诱导和持续过程中发挥着重要作用。黄芩清热除痹胶囊(HQC)是临床上治疗RA有效的中药方剂,但其治疗机制尚未完全阐明。本研究采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)、16SrRNA测序、Western blot(WB) )、免疫荧光等方法探讨HQC是否抑制RA。基于小鼠胶原诱导关节炎(CIA)模型、人结肠癌细胞系(Caco-2)和来自成纤维细胞样滑膜细胞(FLS)的研究在RA患者中,我们发现CIA模型组肠道菌群紊乱,肠道屏障受损,脂多糖(LPS)水平升高,而HQC可以调节肠道菌群和肠道屏障,减少LPS转入血液。抗生素耗尽削弱了 HQC 的抗 RA 作用,而 HQC 粪便微生物群移植减轻了 RA 病理。此外,LPS可增加RA病理因子MMP3、纤连蛋白和炎症因子IL-6、TNF-α、IL-1β和IL-8的表达,表明外周血LPS水平升高与RA病理相关。肠道菌群和肠道屏障的破坏是RA发生的重要因素。 HQC 通过调节肠道菌群、肠道屏障和抑制 LPS 转入血液来改善 RA。该研究揭示了RA的新发病机制,为推进RA的HQC治疗奠定了科学基础。版权所有©2024 Peng, Huang, Li, Li, Wu, Chen, Wang, Liao and Miao。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Jun 30
JunheChen,GuifangHe,...
Lactic acid: a narrative review of a promoter of the liver cancer microenvironment.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
乳酸是体内产生的糖酵解的代谢产物,其产生被认为是癌细胞逃避免疫监视的一种机制。免疫逃避和代谢变化已被确定为癌症的基本标志。尽管乳酸长期以来一直被认为是一种废物,但现在人们普遍认为它是一种多功能小分子化学物质,在肿瘤微环境 (TME) 中发挥着重要作用,乳酸产量的增加与人类恶性肿瘤的发展有关。肝癌中的代谢转向糖酵解,这增强了肿瘤细胞用于产生蛋白质、脂质和核苷酸的代谢化合物的产生,使它们能够维持高增殖率并建立 TME。由于肿瘤细胞中无氧糖酵解速率产生的乳酸具有免疫抑制活性,肝癌中代谢活性的失调可能会损害抗肿瘤反应。本综述主要探讨乳酸与 TME 之间的联系;评估乳酸在肝癌发生、转移、预后和治疗中的作用。此外,它还研究了作为肝癌治疗潜在靶点的相关途径。在 PubMed、Web of Science 和 Google Scholar 中进行了文献检索,最新文章的发表日期为 2024 年 1 月。在消除重复文章和更少文章后通过标题和摘要的相关文章,我们选择了 113 篇文章进行本次综述。我们将参考文献分为两类。一是将内容分为乳酸相关、肝癌相关和肿瘤代谢相关。另一种是对文章类型进行分类,分为综述、研究文章和临床试验。此外,我们还查阅了相关文章的参考文献列表,以确保覆盖范围全面且公正。乳酸与TME之间的联系最近成为人们广泛关注的领域,并且该领域已经发表了许多相关文章。本综述的主要发现是总结乳酸与 TME 之间已证实的联系及其对肝癌 TME 的可能影响。并分析了乳酸在肝癌治疗和预后预测中的潜力。乳酸可能是未来开发肝癌治疗新方法的关键。经典疗法与分子靶向药物相结合的相关研究可能会提供更有选择性地调节免疫细胞活性的创新药物。2024年胃肠肿瘤学杂志。版权所有。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Jun 30
NipunVerma,KimberlyL...
A single arm phase 2 clinical trial of YIV-906 with neoadjuvant concurrent chemo-radiation therapy in patients with locally advanced rectal cancer.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
直肠癌的术前放化疗通常与严重的胃肠道(GI)毒性有关,可能会中断、延迟和/或导致治疗终止。在这项研究中,我们评估了 YIV-906(一种被证明可以减少化疗相关胃肠道毒性的新型草药)的添加是否也可以减少新辅助治疗中标准术前卡培他滨和盆腔放射治疗 (RT) 期间的胃肠道副作用。这项单组临床研究于2014年12月23日至2018年9月17日期间在耶鲁纽黑文医院综合癌症中心Smilow癌症医院入组了24名患者。所有患者年龄≥18岁,东部肿瘤合作组0-1组,组织学证实为T3-T4和N0-N2、M0直肠腺癌。中位随访时间为 61.9 个月。所有患者同时接受盆腔外照射放疗(50.4 Gy,28 次)、YIV-906(每周放疗第 1-4 天口服 800 mg,每天两次),并以新辅助方式口服卡培他滨,然后接受确定性手术。在放射期间每周评估毒性,直到急性症状解决,然后在第 28 天、4 个月、7 个月和 10 个月评估毒性。毒性按照不良事件通用术语标准 (CTCAE) 4.0 版进行分级。手术时,4 名患者 (16.7%) 出现完全或接近完全缓解。中位随访时间为 61.9 个月,我们患者队列的平均总生存期 (OS) 为 74.9 个月 [95% 置信区间 (CI):67.3-82.5]。估计 5 年 OS 为 82.0%。我们观察到 0% 的急性 4 级毒性,仅两例急性 3 级腹泻 (8.3%)。与历史对照相比,在基于卡培他滨的放化疗中添加 YIV-906 导致胃肠道毒性发生率降低。特别是 3 级或以上腹泻。这些发现表明,YIV-906 应该在随机临床试验中进行评估,以进一步评估放化疗对胃肠道癌症毒性特征的潜在降低。2024 年胃肠肿瘤学杂志。版权所有。
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