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肿瘤
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
2023 Feb 20
AlexanderGRaufi,Mich...
Advances in Liquid Biopsy Technology and Implications for Pancreatic Cancer.
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
胰腺癌是一种高度侵袭性的恶性肿瘤，发病率逐渐上升。大多数病例在晚期发现，伴有不可治愈的局部晚期或转移性疾病。即使是接受手术切除的人，复发率也非常高。目前没有普遍接受的筛查方式适用于普通人群，而且诊断、评估治疗反应和复发检测主要依赖于影像学的使用。迫切需要识别出微创技术来帮助诊断、预后、预测治疗反应或耐药性以及检测复发。液体活检代表了一种新兴的技术组，可以进行非侵入性的肿瘤物质连续取样。尽管液体活检平台的敏感性和特异性还未被批准用于胰腺癌的常规使用，但现代液体活检平台的不断改进将有可能在不久的将来改变临床实践。在本综述中，我们将讨论液体活检的最新技术进展，重点关注循环肿瘤DNA、外泌体、微RNA和循环肿瘤细胞。
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INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
2023 Feb 20
FedericaCosso,Giando...
Adjuvant Therapy for Renal Cell Carcinoma: Hype or Hope?
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
肾细胞癌(RCC)是第三常见泌尿生殖系统恶性肿瘤，2020年全球死亡人数达到约18万。尽管超过三分之二的患者最初呈现局部病变，但其中高达50%的患者可能发展为转移性疾病。辅助治疗旨在降低多种癌症复发风险并改善预后，但目前在RCC中尚未满足需求。酪氨酸激酶抑制剂在转移性RCC中取得的结果导致对这些靶向治疗在早期应用于RCC中的评估，围绕无疾病生存期的结果存在冲突，整体生存期(OS)没有益处。同样，免疫检查点抑制剂(ICIs)在辅助治疗中的结果也存在冲突。虽然可用数据未显示ICIs在早期阶段有OS改善，但记录了Pembrolizumab的积极趋势，在此应用中获得了美国食品和药物管理局的批准。但是，几种ICIs的令人失望的结果和RCC的不均匀模式需要鉴定生物标记和亚组分析，以评估哪些患者可以从辅助治疗中获益。在本评述中，我们将讨论RCC的辅助治疗理念，总结最重要的辅助治疗试验和当前应用，以概述可能的未来方向。
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INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
2023 Feb 20
AntoineGaudreau-Lapi...
Nuclear High Mobility Group A2 (HMGA2) Interactome Revealed by Biotin Proximity Labeling.
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
非组蛋白染色质结合蛋白高迁移率族(AT)-钩蛋白2 (HMGA2) 在染色质重塑、基因组维护和保护中具有重要功能。 HMGA2 的表达在胚胎干细胞中最高，在细胞分化和衰老过程中下降，但在某些癌症中重新表达，其中高 HMGA2 表达通常与不良预后相吻合。 HMGA2 的核功能不能仅通过结合染色质来解释，而涉及到与其他蛋白质的复杂相互作用，其机理尚未完全理解。 本研究利用生物素近距标记，随后进行蛋白质组学分析，以识别 HMGA2 核相互作用伴侣。 我们测试了两种不同的生物素连接酶 HMGA2 构型(BioID2 和 miniTurbo)，并发现已知和新的 HMGA2 相互作用伴侣，其功能主要在染色质生物学中。 这些 HMGA2 生物素连接酶融合构建物为相互作用组可发现研究提供了令人兴奋的新机会，可以在药物治疗期间监测核 HMGA2 相互作用组。
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INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
2023 Feb 20
MichelaPecoraro,Adel...
Vx-809, a CFTR Corrector, Acts through a General Mechanism of Protein Folding and on the Inflammatory Process.
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
蛋白质正确折叠是细胞健康的基础；因此，内质网（ER）中错折叠蛋白质的积累导致内平衡失调，造成ER压力。各种研究表明，蛋白质误折叠是很多人类疾病的发病重要因素，包括癌症、糖尿病和囊性纤维化。ER中错折叠蛋白质的积累会启动复杂的信号转导途径——未折叠蛋白质反应（UPR），该途径由控制ER内部的三种蛋白质IRE1α、PERK和ATF6控制。简单地说，当ER压力无法逆转时，IRE1α会诱导炎症前体蛋白的激活；PERK会磷酸化eIF2α，促进ATF4基因的转录；而ATF6会激活编码ER分子伴侣蛋白的基因。网络压力会改变钙离子的平衡，钙离子从ER中释放，被线粒体吸收，导致氧自由基的产生增加，从而导致氧化压力。细胞内钙离子的积累，加上致命的活性氧水平，与炎症过程的启动和炎症前体蛋白的表达增加有关。Lumacaftor（Vx-809）是治疗囊性纤维化的常用矫正剂，可增强突变的F508del-CFTR的折叠，该蛋白质是导致该病的最普遍损伤蛋白质之一，从而促进突变蛋白质在细胞膜上的更高定位。我们在这里展示了这种药物减轻ER压力以及由此引起的炎症现象。因此，这种分子是治疗由蛋白质聚集造成慢性网络压力的几种疾病的有前途的药物。
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INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
2023 Feb 20
DomenicoGalati,Seren...
Dendritic Cell and Cancer Therapy.
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
樹突細胞(DCs)被認為是最具效力的專業抗原呈現細胞(APCs)，能夠誘導適應性免疫並支持先天免疫反應[...]。
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Journal of Ovarian Research
2023 Jan 27
LinglingGao,FeiquanY...
Identification and validation of pyroptosis-related gene landscape in prognosis and immunotherapy of ovarian cancer.
Journal of Ovarian Research
新兴证据强调了细胞威瑞森病在肿瘤发生和进展中的生物学意义。然而，细胞威瑞森病在卵巢癌的免疫微环境及靶向治疗中的潜在作用仍未知晓。本研究采用一系列生物信息学和机器学习方法，全面评估了TCGA-OV数据库中细胞威瑞森病相关基因（PYAGs）的遗传变异和转录组特征。进行一致性分子聚类以确定细胞威瑞森病相关簇（PACs）和卵巢癌基因簇。随后，采用组分分析算法（PCA）构建Pyrsig评分，并建立了高度准确的评分图来评估其功效。同时，我们系统性地分析了这些组与预后、临床特征、TME细胞浸润特征、药物反应和免疫治疗效果之间的关联。还进行免疫组织化学实验验证了临床样本中的分子表达。澄清了51个PYRGs基因在OC样本中的体细胞突变和拷贝数变异（CNV）。基于1332个OC样本，鉴定出两个不同的PACs（PAC1 / 2）和三个基因簇（A / B / C）。PAC1和基因簇A与良好的总生存率（OS）、临床病理特征和TME细胞浸润特征显著相关。随后，成功建立了Pyrsig评分，以显示细胞威瑞森病在OC中的预后价值和免疫特征，低Pyrsig评分，其特点为激活的免疫细胞浸润，预示着延长生存期、提高某些化疗药物的敏感性、增强抗PD-L1免疫治疗的效果。因此，成功建立了一个评分图，以提高Pyrsig评分的临床适用性和稳定性。用OC临床样本验证了GSDMD和GZMB蛋白在OC中高表达，并与免疫浸润和Pyrsig评分相关，GZMB和CD8蛋白被认为是OC的独立预后因素。本研究揭示了细胞威瑞森病在OC中在预后价值、临床病理特征和肿瘤免疫浸润微环境中发挥着不可忽视的作用，为鉴定和表征肿瘤免疫微环境的统景开了新的视角，从而指导OC更有效的预后评估和个体化免疫治疗策略。 © 2023. 作者。
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Journal of Ovarian Research
2023 Jan 30
HailinYu,JieyuWang,B...
Prognostic significance and risk factors for pelvic and para-aortic lymph node metastasis in type I and type II ovarian cancer: a large population-based database analysis.
Journal of Ovarian Research
比较I型和II型上皮性卵巢癌（OC）淋巴转移的预后，并确定盆腔淋巴结转移（PLN）和副主动脉淋巴结转移（PALN）的风险因素。从观察流行病学和最终结果（SEER）数据库中收集被诊断为上皮性OC的患者。估计总体生存率（OS）和癌症特异性生存率（CSS）。使用Cox比例风险回归模型来确定独立的生存预测因子。共有11,275例OC患者入组，其中31.2%为I型，68.8%为II型。II型和高肿瘤分期是淋巴结累及的风险因素（p < 0.05）。I型患者淋巴结转移率总体为11.8％，而II型为36.7％。在I型组中，T1、T2、T3和TXM1阶段的淋巴结转移率分别为3.2％、14.5％、40.4％和50.0％。而在II型组中，这些率分别为6.4％、20.4％、54.1％和61.1％。年龄和肿瘤大小对淋巴结转移的影响较小，而3级分化并不总是风险因素。对于I型组，LN (-)、PLN（+）、PALN（+）和PLN + PALN（+）的10年CSS率分别为80.6％、46.6％、36.3％和32.3％。I型组PLN（+）的预后优于PALN（+）（p> 0.05）。对于II型组，LN (-)、PLN（+）、PALN（+）和PLN + PALN（+）的10年CSS率分别为55.6％、18.5％、25.7％和18.2％。在II型组中，PALN（+）的预后优于PLN（+）（p < 0.05）。I型和II型患者的临床特征和预后有很大差异。II型和肿瘤分期较高的患者的预后较差。I型PALN转移和II型PLN转移表明预后较差。TI期患者不需要淋巴结清扫，特别是在I型患者中。©2023年作者。
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Journal of Ovarian Research
2023 Feb 01
DeepaBhartiya,Diksha...
VSELs and OSCs together sustain oogenesis in adult ovaries and their dysfunction results in age-related senescence, PCOS, POI and cancer.
Journal of Ovarian Research
多项使用单细胞RNA测序（scRNAseq）的研究未能检测到成年卵巢中的干细胞。我们坚信，在经过苏木精和伊红染色的卵巢表面上皮（OSE）细胞涂片中，可以轻松地检测到两个卵巢干细胞群体，包括多能的，非常小胚胎样干细胞（VSELs）和组织专用的“前体细胞”，被称为卵巢干细胞（OSCs），这些样本可以从小鼠和人类卵巢中制备。可能是因为干细胞只通过将细胞悬液离心1000 g来沉淀，而用于scRNAseq的细胞则始终通过将细胞悬液离心200-400 g来制备。最近一篇文章进一步解释了scRNAseq未能检测到卵巢干细胞的原因。使用先进的软件对(scRNAseq)产生的数据进行了广泛的重新分析，并成功检测到了OSCs和有支持成年人卵巢新生的减数分裂标记物。但这篇文章仍然对VSELs的生物学相关性及其与OSCs之间的关系保持批评态度。通过仔细研究通过部分胰蛋白酶消化完整小鼠卵巢在不同的发情周期阶段制备的OSE细胞涂片（其中包含VSELs，OSCs和生殖细胞巢GCNs），我们成功地描绘了VSELs / OSCs在生理条件下的新功能。 VSELs经历不对称的分裂进行自我更新，并产生稍微大一些的OSC，而这些OSC再进行对称分裂和克隆扩增，形成GCNs，被认为是新生卵和卵泡组装的正常过程。在胎儿卵巢和FSH处理下的成年卵巢OSE细胞培养中，GCNs已经被早期描述过。新生儿时期暴露于内分泌干扰物的毒害会导致VSELs / OSCs（这些细胞表达ERα，ERβ和FSHR）功能失调，从而导致卵巢功能不足和多囊卵巢。VSELs也与卵巢癌有关。年龄相关的卵巢老化/更年期也与VSELs / OSCs的功能失调和阻塞分化有关。这些新的真实发现以及存在于已发表文献中的丰富的体外和线索追踪研究数据为进一步的研究提供了巨大的空间，提供了管理卵巢病理的新途径，并呼吁重新编写教科书。 ©2023年作者。
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Journal of Ovarian Research
2023 Feb 04
JingFeng,YipingYu,We...
Development and verification of a 7-lncRNA prognostic model based on tumor immunity for patients with ovarian cancer.
Journal of Ovarian Research
免疫反应和长链非编码RNA都在卵巢癌（OC）的增殖、侵袭和转移中发挥重要作用。本研究旨在为OC患者构建一个免疫相关的lncRNA风险模型。使用单样本GSEA（ssGSEA）算法分析癌症基因组图谱（TCGA）中免疫细胞的比例，使用hclust算法根据免疫细胞的比例进行免疫分类。应用ESTIMATE算法计算出基质和免疫得分。使用加权基因共表达网络分析（WGCNA）和差异表达基因（DEGs）分析检测免疫簇相关的lncRNA。进行最小绝对收缩和选择算子（LASSO）回归进行lncRNA选择。所选的lncRNA被用于构建与预后相关的风险模型，并在基因表达混杂物数据库和体外验证中进行验证。通过ssGSEA分析，我们鉴定出两个亚型，高免疫簇（immunity_H）和低免疫簇（immunity_L）。在高免疫簇（immunity_H）的病人比例显著高于低免疫簇（immunity_L）的病人比例。ESTIMATE相关分数在高免疫组中相对较高。通过WGCNA和LASSO分析，我们鉴定出141个免疫簇相关lncRNA，并发现这些基因主要富集在自噬中。包括AL391832.3、LINC00892、LINC02207、LINC02416、PSMB8.AS1、AC078788.1和AC104971.3在内的由7个lncRNA组成的标志物被选择作为将患者分为高和低风险组的基础。生存分析和ROC曲线下面积（AUC）表明，该风险模型在预测OC患者预后方面具有很高的准确性。我们还进行了药物敏感预测，并发现雷帕霉素在高风险评分患者中效果更佳。体外实验也证实了我们的预测。我们发现了7个免疫相关的预后性lncRNA，有效地预测了OC患者的生存。这些发现可能为这些患者的临床分层管理和个性化治疗提供有价值的指标。©2023年作者。
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Journal of Ovarian Research
2023 Feb 06
QiaoPingXu,KuiDeng,Z...
SLFN5 promotes reversible epithelial and mesenchymal transformation in ovarian cancer.
Journal of Ovarian Research
卵巢癌是一种全球发病率逐年增加的疾病，迫切需要化学治疗和生物靶向治疗。上皮-间充质转化（EMT）是肿瘤细胞获得侵袭和转移能力的重要启动阶段。越来越多的发现表明，人类Schlafen家族成员5（SLFN5）在异常增殖中发挥着关键作用。然而，SLFN5在卵巢癌细胞中的作用尚未完全阐明。样本来自杭州市第一人民医院诊断为卵巢癌的患者，并通过荧光定量PCR检测SLFN5的表达。利用癌症基因组图谱（TCGA）数据库的表达谱数据，分析了SLFN5表达与卵巢癌进展和恶性程度的关系。利用荧光定量PCR研究了SLFN5相关上游和下游信号通路的mRNA表达水平。通过siRNA转染进行SLFN5沉默。通过Western blot检测SLFN5和相关转移蛋白的表达。Transwell和划痕愈合实验研究了卵巢癌细胞的迁移和侵袭能力。TCGA数据库分析结果显示，在高SLFN5表达人群中，与低SLFN5表达组相比，OS较差（P = 0.011）。SLFN5沉默对卵巢癌细胞EMT和侵袭运动具有显著的抑制作用。采用RT-PCR方法检测卵巢癌组织和邻近组织中SLFN5 mRNA的变化。结果发现，卵巢癌组织中SLFN5的表达增加，具有显著差异（P <0.05）。综上所述，这些结果表明SLFN5可能在卵巢癌细胞的肿瘤发生和发展中发挥协同作用，为未来卵巢癌治疗的药物开发提供了一个潜在靶点。 © 2023.作者
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