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BIOINFORMATICS
2024 Jul 10

HamedVasei,Mohammad-...
Weighted Centroid Trees: A general approach to summarize phylogenies in single-labeled tumor mutation tree inference.
BIOINFORMATICS
肿瘤树描述了癌症的进化过程,为发现癌症中反复出现的进化过程提供了基础。虽然它们不是从基因组数据中提取的主要信息,但它们对于此目的很有价值。一种这样的提取方法涉及将多个树汇总为单个代表性树,例如共识树或超级树。我们定义加权质心树问题,通过以下步骤找到一组单标记有根树的质心树:1)映射将给定的树放入欧几里德空间,2)计算映射树的加权质心矩阵,3)找到距离质心矩阵最近的映射树(NMTP)。我们表明,此设置包含先前研究的父子和祖先后代指标以及 GraPhyC 和 TuELiP 共识树算法。此外,我们表明,虽然 NMTP 问题对于邻接嵌入来说是多项式时间可解的,但对于祖先和距离映射来说是 NP 困难的。我们在不同的设置中引入了 NMTP 的整数线性程序,其中我们还为祖先嵌入的情况提供了一种称为 2-AncL2 的新算法,该算法对祖先信号使用了一种新颖的加权方案。我们的实验结果表明,与现有的共识树算法相比,2-AncL2 具有优越的性能。我们还说明了我们的设置在为大型真实乳腺癌数据集提供代表性树方面的应用,推断聚类质心树总结了有关原始数据集的可靠进化信息。https://github.com/vasei/WAncILP。补充材料可在在线生物信息学。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。
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Best Pract Res Cl Ob
2024 Jul 10

DanielaVölz,Reinhard...
"Not me!" a qualitative, vignette-based study of nurses' and physicians' reactions to spiritual distress on neuro-oncological units.
Best Pract Res Cl Ob
原发性恶性脑肿瘤患者因预后有限和症状负担高而遭受严重的健康相关痛苦。因此,神经肿瘤医护人员的情绪可能会受到负面影响。本研究的目的是分析护士和医生在面对这些患者精神困扰时的态度和行为。Neurospirit-DE 是一项在德国巴伐利亚州进行的基于小插曲的定性、多中心、横断面在线调查。采用反思性主题分析法进行数据分析。共有46家医院神经内科和神经外科病房的143名护士和医生参与了调查。参与者质疑提供精神关怀的能力是否可以学习或是否是一种自然技能。强调精神关怀是整个团队的责任,员工们反思了精神关怀专家参与的适当方式。精神护理的主要限制是缺乏时间,并且没有将精神参与视为专业角色的一部分。有些人能够从与患者的精神对话中受益,但许多参与者批评了感知到的情感负担,同时表示迫切需要进行具体培训和团队反思。大多数神经肿瘤护士和医生将精神护理视为其职责的一部分,并且知道如何进行以减轻患者的精神困扰。尽管如此,神经肿瘤学精神评估工具的验证和患者痛苦的标准化记录、共享的跨专业培训以及对神经肿瘤学精神护理时面临的专业和个人挑战的反思都需要进一步改进和培训。© 2024。作者。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2024 Jul 10

SaeedehShariati,Moha...
Epicatechin as a promising agent against arsenic-induced neurobehavioral toxicity in NMRI mice: behavioral and biochemical alterations.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
表儿茶素 (Epi) 是不同水果和茶叶中最丰富的黄酮类化合物之一。新兴研究阐明了儿茶素在不同器官中抵御砷 (As) 暴露的破坏性影响的巨大潜力。本研究旨在了解 Epi 是否在小鼠模型中对砷引起的神经毒性具有治疗功效。医学研究所 (NMRI) 小鼠被随机分为 6 个不同组,其中包括接受生理盐水的对照组、连续 5 周每日口服砷 (10 mg/kg) 的组、接受 As (10 mg/kg) 的组。 kg/天)口服 5 周,最后 2 周口服不同剂量的 Epi(25-100 mg/kg),一组口服 Epi(100 mg/kg)2 周。为了评估 Epi 的潜在影响,我们对神经行为测试、氧化应激和炎症的各种参数进行了评估。这项研究的结果表明,As 诱导的神经行为毒性与脂质过氧化和一氧化氮 (NO) 浓度的显着升高有关,伴随着抗氧化标记物水平的降低。观察到包括肿瘤坏死因子-α (TNF-α) 在内的促炎细胞因子水平升高,同时观察到核因子 kappa B (NF-κB) 和核因子红细胞 2 相关因子 2 (Nrf2) 表达增强。然而,Epi 治疗逆转了这些影响。总的来说,这些发现表明 Epi 可能通过改善抗氧化状态、减轻氧化应激和炎症来对 As 诱导的神经毒性发挥治疗功效。尽管如此,还需要进一步的研究来全面掌握 Epi 在这种特定情况下的潜在保护作用。© 2024。作者获得 Springer-Verlag GmbH 德国(Springer Nature 旗下公司)的独家许可。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2024 Jul 10

CarolinaCalderón-Chi...
Jackfruit Leaf Protein Hydrolysates Obtained by Enzymatic Hydrolysis of Leaf Protein Concentrate with Pepsin and Pancreatin: Molecular Weight, Cytotoxicity, Antiproliferative Activity, and Oxidative Stress.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
菠萝蜜叶蛋白水解物是通过胃肠道酶对叶蛋白浓缩物进行酶解而获得的,具有良好的技术功能特性和高抗氧化能力。然而,其分子量、抗增殖活性、细胞毒性和减少活性氧(ROS)的能力仍然未知。因此,本研究旨在评估在不同水解时间(30-240分钟)下用胃蛋白酶和胰酶酶解获得的菠萝蜜叶蛋白水解物对分子量、细胞毒性、抗癌细胞增殖和减少活性氧的影响。在 H2O2 诱导的 HaCaT 细胞中。电泳图谱表明 H-Pep 含有分子量在 25 - 20 kDa 之间的肽。同时,H-Pan 由分子量介于 25 - 20 kDa 和 < 20 kDa 之间的产品组成。 H-Pan 和 H-Pep (125-500 µg/mL) 对 HaCaT(人角质形成细胞)和 J774A.1(鼠巨噬细胞)没有表现出显着的细胞毒性。在人宫颈癌、卵巢癌和肝癌细胞中取得了抗增殖活性。 H-Pan-240 分钟 (1000 µg/mL) 使宫颈癌细胞的细胞活力降低 23%,而 H-Pan-60 分钟则使卵巢癌细胞和肝癌细胞的细胞活力显着降低 14.5% (500 µg/mL) 和 17% % (1000 µg/mL),分别 (P < 0.05)。 H-Pep-60 分钟对 H2O2 应激的 HaCaT 细胞具有抗氧化应激的保护作用,在 250 µg/mL 浓度下可减少 25% 的 ROS(P<0.05)。研究结果证明了绿色生物质作为植物蛋白水解物来源的安全使用。© 2024。作者获得 Springer Science Business Media, LLC(Springer Nature 旗下公司)的独家许可。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2024 Jul

SoukainaLaaraj,Ibtis...
Immunostimulant effect of dates (Phoenix dactylifera) on humoral and cellular immunity cells and their functions.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
该研究旨在评估枣子的免疫调节作用,枣子是摩洛哥人用来增强对病原体免疫力的传统药物。这项研究旨在评估这种水果对免疫细胞及其功能的影响。为了实现这一目标,我们使用枣提取物对脾细胞、胸腺细胞和巨噬细胞进行了测试,重点关注它们的功能:抗体产生、吞噬作用和 T 淋巴细胞毒性。结果表明,海枣果实水提物对体液免疫具有显着的免疫刺激作用。与对照细胞相比,它通过增强补体活性并将脾细胞(包括 B 淋巴细胞)增殖增加 142.5% 来实现这一目标。同样,在相同条件下,通过胸腺细胞活性显着刺激细胞免疫,导致细胞增殖显着增加(225%)和胸腺细胞功能增强(245.9%),从而起到预防癌症的作用。此外,枣子提取物还具有抗炎特性。这在乙酸乙酯提取物下巨噬细胞介导的吞噬活性增加中显而易见,从而有效地消除病原体。评估枣提取物的美容潜力表明,乙酸乙酯提取物具有抗炎和强抗氧化作用,对紫外线 B 射线具有较高的光吸收能力。基于这些发现,我们建议研究该提取物作为防晒霜的用途。此外,傅里叶变换红外光谱分析表明,存在的最活跃的化合物是类黄酮。这些结果证实了这种水果增强免疫力的传统用途。版权所有©,埃及免疫学家协会。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2024 Jul 09

Yang-Ying-FanFeng,Yi...
Synthetic lethal CRISPR screen identifies a cancer cell-intrinsic role of PD-L1 in regulation of vulnerability to ferroptosis.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
尽管程序性细胞死亡 1 (PD-1)/程序性死亡配体 1 (PD-L1) 抑制在肿瘤治疗中取得了成功,但许多患者并未受益。这种失败可能归因于 PD-L1 的内在功能。我们进行了全基因组 CRISPR 合成致死性筛选,系统地探索 PD-L1 在头颈鳞状细胞癌 (HNSCC) 细胞中的内在功能,确定铁死亡相关基因对于 PD-L1 缺陷细胞的生存至关重要。铁死亡的遗传和药理学诱导会加速 PD-L1 敲除细胞的细胞死亡,这些细胞也更容易受到免疫原性铁死亡的影响。从机制上讲,核 PD-L1 转录激活 SOD2 以维持氧化还原稳态。在 PD-L1 表达较高的 HNSCC 患者中观察到较低的活性氧 (ROS) 和铁死亡。我们的研究表明,PD-L1 通过激活 SOD2 介导的抗氧化途径赋予 HNSCC 细胞铁死亡抵抗力,这表明针对 PD-L1 的内在功能可以增强治疗效果。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2024 Aug 01

ZaferCirak,AlpaslanT...
Certolizumab Has Favorable Efficacy on Preventing Pancreas and Target Organs Damage in Acute Pancreatitis.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
目的 通过生化参数和组织病理学评分评估赛妥珠单抗对实验性急性胰腺炎(AP)胰腺及靶器官的疗效。 将 40 只雄性 Sprague Dawley 大鼠分为以下 5 个相等的组:第 1 组(假手术组)、第 1 组(假手术组)、第 1 组(假手术组)、第 1 组(假手术组)第2组(AP组)、第3组(AP低剂量赛妥珠单抗组)、第4组(AP高剂量赛妥珠单抗组)和第5组(安慰剂组)。最后一次注射后24小时处死各组大鼠,检测血样中淀粉酶、肿瘤坏死因子α、转化生长因子β、白细胞介素1β、丙二醛、超氧化物歧化酶、谷胱甘肽过氧化物酶的水平。由对各组不知情的病理学家对胰腺和靶器官(肺、肝、心脏、肾)进行组织病理学研究。还完成了计算机分析。赛妥珠单抗治疗组的生化结果明显优于 AP 组(P < 0.001)。高剂量组(第4组)和低剂量治疗组(第3组)在生化参数和组织病理学评分方面存在显着差异(P < 0.001)。在赛妥珠单抗治疗对靶器官(尤其是肺组织)的影响方面,低剂量治疗组(第3组)和高剂量治疗组(第4组)与AP组(第2组)的差异Certolizumab对AP胰腺及靶器官具有良好的保护作用。它可能是 AP 治疗的有益药物,并且可以预防靶器官损伤。版权所有 © 2024 Wolters Kluwer Health, Inc. 保留所有权利。
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ANNALS OF SURGICAL ONCOLOGY
2024 Jul 10

TakeshiOmori,Kazuyos...
Long-Term Effects of Oral Nutritional Supplements After Gastrectomy for Gastric Cancer: A Survival Analysis from a Multicenter, Open-Label, Randomized Controlled Trial.
ANNALS OF SURGICAL ONCOLOGY
胃癌胃切除术后体重减轻(WL)与辅助化疗依从性降低和生存受损有关。本研究探讨了胃切除术后 3 个月服用口服营养补充剂 (ONS) 对辅助化疗依从性和生存结果的影响。这项大规模、多中心、开放标签、随机对照试验纳入了 1,003 名接受根治性治疗的胃癌患者。胃切除术。患者被分配到对照组(n = 503)或ONS组(n = 500)。在 ONS 组中,胃切除术后 3 个月内,除了常规饮食外,还建议每天摄入 400 kcal ONS。比较两组辅助化疗依从性及生存结局。与对照组相比,ONS组胃切除术后3个月WL显着降低(分别为8.6±6.1% vs 7.2±5.7%,P=0.0004)。对照组和 ONS 组在辅助化疗的诱导率(分别为 84.9 vs. 82.8%,P = 0.614)或术后 3 个月的继续率(分别为 75.3 vs. 76.6%,P = 0.809)方面没有差异。口服营养补充剂 3 个月没有显示出生存益处;对照组3年和5年总生存率(OS)分别为91.3%和87.6%,ONS组分别为89.6%和86.4%,差异无统计学意义(P = 0.548)。亚组分析无法检测到 ONS 给药增加 OS 的人群。胃切除术后 3 个月给予 ONS 与辅助化疗依从性增加或预后改善无关。© 2024。外科肿瘤学会。
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ANNALS OF SURGICAL ONCOLOGY
2024 Jul 10

MianChen,ShengheDeng...
Mitochondrial DNA Copy Number as a Biomarker for Guiding Adjuvant Chemotherapy in Stages II and III Colorectal Cancer Patients with Mismatch Repair Deficiency: Seeking Benefits and Avoiding Harms.
ANNALS OF SURGICAL ONCOLOGY
具有错配修复缺陷/微卫星不稳定性高(dMMR/MSI-H)状态的结直肠癌(CRC)患者通常被认为对辅助化疗(ACT)无反应。线粒体转录因子 A (TFAM) 是线粒体 DNA 拷贝数 (mtDNA-CN) 表达所必需的。鉴于之前的研究结果表明 TFAM 的频繁截短突变会影响 MSI CRC 细胞的化疗耐药性,本研究旨在探讨 mtDNA-CN 作为 dMMR CRC 患者 ACT 疗效预测生物标志物的潜力。使用定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) 对 308 名患有 dMMR 的 CRC 患者(其中 180 名 II 期患者和 128 名 III 期患者)进行了 CN 评估。收集临床病理学和治疗数据。该研究探讨了 mtDNA-CN 水平与预后之间的关联,以及 ACT 获益对 dMMR CRC 患者的影响。主要根据肿瘤分期和mtDNA-CN水平进行亚组分析。采用Kaplan-Meier和Cox回归模型评估mtDNA-CN对无病生存(DFS)和总生存(OS)的影响。在肿瘤组织中观察到mtDNA-CN表达大幅减少,并且mtDNA-CN表达升高。 CN 水平与 dMMR CRC 患者的 DFS(73.4% vs 85.7%;P = 0.0055)和 OS(82.5% vs 90.3%;P = 0.0366)改善相关。 Cox 回归分析确定高 mtDNA-CN 是 DFS(风险比 [HR] 0.547;95% 置信区间 [CI] 0.321-0.934;P = 0.0270)和 OS(HR 0.520;95% CI 0.272-0.998)的独立保护因素; P = 0.0492)。值得注意的是,对于 mtDNA-CN 升高的 dMMR CRC 患者,ACT 显着改善 DFS(74.6% vs 93.4%;P = 0.0015)和 OS(81.0% vs 96.7%;P = 0.0017),包括 II 期或 III 期疾病的患者。 mtDNA-CN 水平与具有 dMMR 的 II 期或 III 期 CRC 患者的预后相关。 mtDNA-CN 升高成为一个强有力的预后因素,表明患有 dMMR 的 II 期和 III 期 CRC 患者的 ACT 结局有所改善。这些发现表明 mtDNA-CN 作为指导该人群个性化 ACT 治疗的生物标志物的潜在效用。© 2024。作者。
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ANNALS OF SURGERY
2024 Aug 01

AndreLMihaljevic,
Postoperative Complications and Mobilization Following Major Abdominal Surgery With Versus Without Fitness Tracker-based Feedback (EXPELLIARMUS): A Student-led Multicenter Randomized Controlled Clinical Trial of the CHIR-Net SIGMA Study Group.
ANNALS OF SURGERY
确定每日术后步数目标和通过健身追踪器 (FT) 的反馈是否可以降低术后并发症的发生率。一直主张早期和加强术后活动以减少术后并发症,但尚不清楚单独 FT 是否可以降低发病率。由学生主导的临床试验网络 SIGMA 在德国 11 所大学医院进行。接受腹部大手术的患者被纳入,配备了 FT,并随机分配到实验组(可见屏幕)或对照干预组(黑屏)。实验组通过英国《金融时报》收到每日步数目标和反馈。主要终点是使用综合并发症指数(CCI)计算的术后 30 天内的发病率。所有试验访问均由医院的医学生进行,并有机会咨询也获得知情同意的外科医生协助者。出院后,医学生通过电话和电子问卷进行术后30天回访,共纳入347例患者。两组之间的基线特征具有可比性。患者的平均年龄为 58 岁,71% 的患者因恶性疾病接受手术,最常见的适应症是胰腺、结直肠和肝胆恶性肿瘤。大约三分之一的患者接受了腹腔镜手术。由于数据完整性为 100%,因此无需对主要终点进行插补。意向治疗分析中两组之间的 CCI 无显着差异(平均值±SD CCI 实验组:23±24 对比对照组:22±22;95% CI:-6.1, 3.7;P= 0.628)。两组之间的所有次要结局,包括恢复质量、6 分钟步行测试、住院时间和术后第 7 天之前的步数,均具有可比性。每日步数目标与基于 FT 的反馈相结合,对术后发病率没有影响。 EXPELLIARMUS 表明医学生可以成功地进行外科随机对照试验。版权所有 © 2024 作者。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版
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